Vandaag werkt het havenbedrijf nog vanuit twee hoofdkantoren: in Terneuzen, nabij het sluizencomplex, en in Gent aan de Skaldenbrug in het Skaldenpark, waar ook verschillende toeleveranciers van Volvo Cars gevestigd zijn. Wat met deze sites gebeurt na de verhuis, is nog niet beslist. Daarnaast beschikt North Sea Port over een bezoekerscentrum aan de Rigakaai in Gent en over het Havenhuis aan de Graslei, een historisch pand dat recentelijk werd gerenoveerd en in gebruik blijft.
Met het nieuwe gebouw wil North Sea Port alle diensten en medewerkers onder één dak samenbrengen, inclusief een modern Port Operations Center voor scheepvaartbegeleiding en veiligheid. Die centralisatie moet de interne werking efficiënter maken en bedrijven in de haven sneller en beter bedienen, zegt de haven.
